종양미세환경( Tumor Microenvironment, TME )은 암세포뿐 아니라 주변 면역세포, 혈관, 기질 세포 등 다양한 구성 요소의 복잡한 상호작용 공간이며, 이곳의 대사체학적 신호 가 암세포의 후성유전체 상태를 비정형적으로 재프로그래밍하는 것이 최근 주요 …

단일세포 공간 전사체학 은 세포 유형별 유전자 발현 패턴뿐만 아니라 해당 세포의 공간적 맥락 까지 동시에 분석하는 첨단 기술입니다. 그러나 서로 다른 실험 조건이나 시점에 얻어진 데이터셋 간의 체계적인 편향, 즉 배치 효과(Batch Effect) 는 데이터 통합 및 …

최근 급부상하는 알파폴드 와 같은 AI 기반 단백질 구조 예측 기술은 신약 개발 초기 단계에서 목표 단백질의 3차원 구조를 빠르고 저렴하게 제공하지만, 실제 약물 결합 및 동역학적 거동 예측에는 여전히 한계가 존재합니다. 현재 학계에서는 정적인 구조 예측 결과를 넘어,…

분자도킹(Molecular Docking)은 생물학적 시스템에서 두 분자, 즉 리간드와 수용체 사이의 가장 안정적인 결합 자세와 친화도를 예측하는 계산 화학 기법이다. 원리 및 과정 탐색(Searching) : 리간드가 수용체의 활성 부위에 들어갈 수 있는 가능한 모든…

전이 금속 이온 은 많은 효소의 촉매 활성 부위에 필수적으로 관여하며, 주변 환경의 이온 배위 상태 변화에 따라 효소의 3차원 구조와 반응성이 정밀하게 조절됩니다. 이러한 조절은 단순히 기질 결합에 국한되지 않고, 효소의 활성 부위 형태 자체를 변화시키며 광범위한 생화…

돌연변이율 변이는 생물의 유전체 수준에서 발생하는 변화의 속도가 환경적 요인이나 계통 발생적 맥락에 따라 달라지는 현상을 의미하며, 이는 종의 적응과 진화생물학 적 분화를 이해하는 데 핵심적인 개념이다. 초기 관찰부터 현대 메커니즘까지 초기에는 단순한 유전적 변이의 누…

리보핵단백질(Ribonucleoprotein, RNP) 은 핵산(주로 RNA ) 분자와 하나 이상의 단백질이 복합체를 형성한 구조를 총칭합니다. 이는 세포 내에서 유전 정보의 발현 및 조절에 필수적인 다양한 기능을 수행하는 거대 분자 복합체입니다. RNP의 기능 mRN…

공간 전사체학 은 조직 내 세포 수준의 유전자 발현 패턴을 공간적 맥락에서 분석하는 기술이며, 이는 단순히 유전자 발현량뿐만 아니라 해당 유전자가 어떤 세포 소기관과 상호작용하는지를 밝히는 데 확장되고 있습니다. RNP 복합체와 세포소기관 상호작용 RNP 복합체 는 m…

유도만능줄기세포(iPSC) 를 통해 분화된 세포 계통의 기능적 건전성은 초기 확립 단계뿐만 아니라 장기적인 배양 환경에서도 유지되는 게놈 안정성 에 달려 있습니다. 안정성 평가 방법론 저배율 유전체 분석 (Low-Pass Genomic Profiling): CNV (C…

RNA 결합 단백질(RBP) 은 mRNA의 5' 말단에 존재하는 mRNA 캡 구조를 특이적으로 인식하여, 해당 mRNA의 번역 시작 여부와 속도를 정밀하게 조절하는 핵심 조절자입니다. 캡-바인딩 및 번역 개시 RBP는 주로 캡 구조와 직접 또는 간접적으로 상호작용하며,…